(Variante Epsilon-Immagine Credit Public Domain).
Tre mutazioni nella proteina spike del coronavirus Epsilon smorzano la potenza neutralizzante degli anticorpi indotti dai vaccini attuali o dalle precedenti infezioni da COVID.
Le mutazioni danno a questa variante preoccupante del coronavirus SARS-CoV-2 un mezzo per eludere totalmente gli anticorpi monoclonali specifici utilizzati nelle cliniche e ridurre l’efficacia degli anticorpi dal plasma delle persone vaccinate.
Per comprendere meglio le esatte strategie di fuga immunitaria al lavoro in questa variante, gli scienziati hanno visualizzato il meccanismo di infezione di questa variante per vedere cosa è diverso dalla configurazione originale del coronavirus pandemico e quali sono le implicazioni di questi cambiamenti.
Il progetto internazionale è stato guidato dal laboratorio di David Veesler nel Dipartimento di Biochimica dell’Università di Washington a Seattle e da Luca Piccoli e Davide Corti di Vir Biotechnology. Per diversi anni, il laboratorio Veesler e i suoi collaboratori hanno esplorato la conformazione molecolare e i meccanismi di infezione dei coronavirus simili alla SARS. Esaminano anche come gli anticorpi tentano di bloccare i meccanismi di infezione e come le varianti escogitano nuovi espedienti.
I loro ultimi dati mostrano che la variante Epsilon “si basa su una strategia di fuga dalla neutralizzazione indiretta e insolita“, secondo i ricercatori.
I loro risultati sono stati pubblicati su Science.
Un’analisi dell’orologio molecolare ha cronometrato l’emergere del precursore della variante Epsilon a maggio del 2020 in California. Entro l’estate del 2020 si era differenziato nei suoi lignaggi B.1.427/B.1.429. I casi di COVID della variante sono aumentati rapidamente e la variante si è presto diffusa negli Stati Uniti. Ora è stata segnalata in almeno 34 altri paesi.
Per saperne di più sulle caratteristiche della variante Epsilon, i ricercatori hanno testato la resilienza contro la variante Epsilon del plasma di persone che sono state esposte al virus e di persone vaccinate. La potenza neutralizzante del plasma contro la variante preoccupante di Epsilon è stata ridotta di circa 2-3,5 volte.
Come l’originale SARS-CoV-2, la variante infetta le cellule bersaglio attraverso la sua glicoproteina spike, la struttura che incorona la superficie del virus. I ricercatori hanno scoperto che le mutazioni Epsilon erano responsabili di riarrangiamenti in aree critiche della glicoproteina spike. Gli studi di criomicroscopia elettronica hanno mostrato cambiamenti strutturali in queste aree. La visualizzazione di queste mutazioni aiuta a spiegare perché gli anticorpi hanno avuto difficoltà a legarsi alla glicoproteina spike. Una delle tre mutazioni nella variante Epsilon ha influenzato il dominio di legame del recettore sulla glicoproteina spike. Questa mutazione ha ridotto l’attività neutralizzante di 14 su 34 anticorpi neutralizzanti specifici per quel dominio, compresi gli anticorpi dello stadio clinico. Le altre due delle tre mutazioni nella variante hanno interessato il dominio N-terminale sulla glicoproteina spike.
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I ricercatori hanno utilizzato la spettrometria di massa e l’analisi strutturale per scoprire che una parte del dominio N-terminale del coronavirus è stata rimodellata da queste mutazioni. Il sito di scissione del peptide segnale è stato spostato nel supersito antigenico NTD e si è formato un nuovo legame disolfuro. Ciò ha comportato una perdita totale di neutralizzazione da parte di 10 anticorpi su 10 testati specifici per il dominio N-terminale nella glicoproteina spike.
Scoprire i meccanismi di evasione immunitaria, come questo nuovo meccanismo basato sulla modifica del peptide segnale, è importante quanto la sorveglianza delle varianti attraverso il sequenziamento dell’RNA. “Insieme”, osservano gli autori, “tali sforzi potrebbero aiutare a contrastare con successo la pandemia in corso”.
Fonte:Science
