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SARS.CoV.2: trovati dati precedentemente non divulgati dai ricercatori cinese

SARS.CoV.2/ Mercato a Wuhan- Immagine: funzionari governativi hanno chiuso il mercato del pesce di Huanan a Wuhan, in Cina, il 1° gennaio 2020 dopo che i medici hanno notato un gruppo di insoliti casi di polmonite ad esso collegati. DAKE KANG/ASSOCIATED PRESS-

Una ricercatrice in Francia ha identificato dati genetici precedentemente non divulgati provenienti da un mercato alimentare a Wuhan, in Cina, che secondo lei e colleghi supportano la teoria secondo cui gli animali infetti da SARS.CoV.2 hanno innescato la pandemia di COVID-19. Diversi ricercatori hanno presentato le loro scoperte martedì al Gruppo consultivo scientifico per le origini dei nuovi agenti patogeni (SAGO), un gruppo di esperti convocato lo scorso anno dall’Organizzazione Mondiale della Sanità.

“I dati indicano ancora di più un’origine dal mercato di Wuhan di SARS.CoV.2”, afferma Kristian Andersen, un biologo evoluzionista presso lo Scripps Research che ha partecipato alla riunione ed è uno degli scienziati che ha analizzato i nuovi dati. In tal caso, i risultati indeboliscono l’opinione di una minoranza secondo cui un laboratorio di virologia a Wuhan era la probabile origine di SARS.CoV.2, forse quando il coronavirus ha infettato un addetto al laboratorio, che lo ha diffuso ulteriormente.

Florence Débarre, una teorica specializzata in biologia evolutiva che lavora presso il Centro nazionale francese per la ricerca scientifica, ha portato alla luce i dati, che consistono in sequenze genetiche pubblicate in GISAID, un database di virologia, da ricercatori cinesi. Il team cinese aveva raccolto campioni ambientali dal mercato del pesce di Huanan, che era collegato a un gruppo di primi casi di COVID-19 e nonostante il suo nome “mercato del pesce”, vendeva anche una varietà di mammiferi. Poiché Débarre ha individuato le sequenze, GISAID le ha rimosse, osservando che la consultazione  era su richiesta al mittente.

Dato che il mistero dell’origine di SARS-CoV-2 è stato oggetto di intenso interesse globale e dibattito controverso, la scoperta dei dati e la successiva scomparsa solleveranno certamente interrogativi sul perché il team cinese, che comprende l’ex capo del Centro cinese per il controllo delle malattie and Prevention (CDC), George Gao, non ha reso pubbliche le sequenze prima. Contattato da Science, Gao ha affermato che “le sequenze non sono niente di nuovo”. Si sapeva che c’era un commercio illegale di animali ed è per questo che il mercato è stato immediatamente chiuso.

Ma Andersen emi suoi colleghi sperano che il team di Gao ora renda le sequenze ampiamente disponibili. “Abbiamo esortato China CDC e i nostri colleghi a rilasciare questi dati il ​​prima possibile”, afferma.

Il team di Gao ha utilizzato i tamponi per raccogliere campioni ambientali da molte delle bancarelle del mercato di Huanan tra il 1° gennaio, giorno in cui è stato chiuso e il 2 marzo 2020. Il gruppo ha riferito lo scorso anno che alcuni dei campioni risultati positivi al SARS-CoV -2 aveva anche materiale genetico umano, ma nessun DNA di altri animali. Il team ha concluso in una prestampa pubblicata su Research Square il 25 febbraio 2022, che questo “suggerisce fortemente” che gli esseri umani abbiano portato il virus sul mercato: una scoperta che Gao e coautori hanno scritto significava che il mercato non era l’origine della pandemia, ma semplicemente diffusione precoce amplificata di SARS-CoV-2. 

Per alcuni ricercatori e funzionari cinesi, quello scenario suggeriva che il virus avesse avuto origine fuori dalla Cina e in qualche modo fosse arrivato a Wuhan. Per i sostenitori delle perdite di laboratorio, ciò implicava che la pandemia potesse essere iniziata nel laboratorio di Wuhan.

Lo studio non è stato ancora pubblicato su una rivista peer-reviewed e la rivista Science ha riferito per la prima volta l’anno scorso che alcuni scienziati si sono chiesti perché un grafico nella prestampa sembrasse mostrare che sequenze di animali fossero state trovate nei campioni ambientali positivi al virus del mercato, ma hanno offerto nessun dato della loro identità. L’analisi presentata al panel dell’OMS questa settimana ora suggerisce che alcuni campioni positivi al coronavirus raccolti contenevano DNA o RNA di cani procioni, zibetti e altri mammiferi ora noti per essere altamente sensibili a SARS-CoV-2.

Débarre afferma che il 4 marzo si è imbattuta “casualmente” nei dati di sequenza precedentemente sconosciuti, mentre svolgeva altre ricerche su GISAID. Le ci vollero cinque giorni per riconoscere l’ampiezza dei dati disponibili e la loro potenziale importanza.

Débarre ha rapidamente contattato Andersen e altri coautori delle sequenze genetiche di due preprint pubblicati nel febbraio 2022 che supportavano la teoria dell’origine del mercato, documenti che secondo lei l’hanno aiutata a spostare l’origine della fuga di laboratorio del virus e a pensare che il virus provenisse probabilmente da animali al mercato del pesce di Huanan. Michael Worobey, un biologo evoluzionista dell’Università dell’Arizona che è stato uno degli autori principali di uno degli articoli, afferma che lui e i suoi collaboratori stanno ancora analizzando le nuove informazioni genetiche, ma finora ha consolidato la sua opinione che SARS-CoV- 2 aveva un’origine zoonotica. (Due preprint di cui è coautore sono state successivamente pubblicate da Science).

Vedi anche:Varianti SARS-CoV-2 hanno origine in pazienti immunocompromessi

“Flo e io abbiamo percorso la stessa strada per essere molto aperti alle idee di fughe di laboratorio, ma diventando sempre più convinti man mano che arrivano sempre più prove che non è così che è successo, e che è il virus SARS-CoV-2 ha avuto vita al mercato di Huanan tramite il commercio di animali selvatici”, dice Worobey a ScienceInsider.

Dati mancanti?

I ricercatori cinesi nel febbraio 2022 hanno pubblicato una prestampa che presentava questo grafico per mostrare che diversi campioni ambientali dal mercato contenenti SARS-CoV-2 avevano anche materiale genetico umano, ma non offrivano dati sui campioni virali mescolati con altre specie animali.

Un grafico che traccia campioni genetici ambientali dal mercato all'ingrosso di frutti di mare di Huanan
G. GAO ET AL ., RESEARCH SQUARE, 25 FEBBRAIO 2022, HTTPS://DOI.ORG/10.21203/RS.3.RS-1370392/V1

Débarre e colleghi hanno in programma di pubblicare un rapporto delle loro scoperte una volta completata l’analisi, ma sperano che i ricercatori cinesi rivedano la loro prestampa per includere i dati della sequenza completa dal mercato di Huanan e lo ripubblichino prima. “Come scienziati, possiamo lavorare insieme su questo”, afferma Andersen.

Andersen aggiunge che non si aspetta che i nuovi dati convincano tutti che il virus ha avuto origine sul mercato. Sospetta che alcune persone possano interpretare le nuove informazioni nel senso semplicemente che gli esseri umani infetti da SARS.CoV.2 hanno trasmesso il virus agli animali al mercato.

Joel Wertheim, un biologo evoluzionista dell’Università della California a San Diego che sta collaborando con Andersen e altri nelle analisi delle sequenze appena scoperte, afferma che alcuni critici dell’ipotesi di spillover vogliono prove più conclusive di quelle che la scienza può eventualmente fornire su SARS.CoV.2.

Fonte: Science

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