Gli scienziati hanno fatto una scoperta che lega fortemente una molecola poco compresa, che è simile al DNA, al cancro e alla sopravvivenza cancro.
Mentre RNA è noto per essere la chiave per il successo della creazione delle proteine delle nostre cellule, il ruolo dei piccoli RNA non codificanti, di recente scoperta, e ancora poco compreso dagli scienziati. Fino ad ora, è stato ipotizzato solo che la maggior parte di queste molecole non aveva niente a che fare con la produzione di proteine. Tuttavia, gli scienziati hanno scoperto che molti RNA non codificanti sono disturbati in cellule umane cancerose, incluse cellule tumorali della mammella e del polmone, in modo specifico.
Gli scienziati della Simon Fraser University, hanno fatto una scoperta che lega fortemente questa piccola molecola che è simile al DNA, al cancro e sopravvivenza al cancro.
La rivista scientifica EMBO ha appena pubblicato online i risultati della ricerca.
RNA non codificanti sono perturbati in cellule umane cancerose e il disturbo si manifesta come lunghezza inferiore della messaggistica molecolare normale e si verifica anche in un punto specifico sui geni.
“Queste due caratteristiche identificabili di danno all’ RNA non codificanti, causano una firma chimica che rende facile per gli scienziati identificarli nelle prime fasi di sviluppo di molti diversi tipi di cancro”, dice Steven Jones.
“L’esistenza di queste molecole” può anche essere usata per classificare i malati di cancro in sottogruppi di individui con differenti risultati di sopravvivenza “, aggiunge Jones. ” La ragione precisa per cui un tumore cambierebbe il comportamento dei geni in questo modo non è nota ed è probabile che si tratti di un meccanismo mediante il quale il cancro può sovvertire l’ attività normalmente ben controllata dei nostri geni”.
Questo studio ha scoperto il ruolo canceroso di RNA non codificanti ‘utilizzando tecniche di sequenziamento high throughput per analizzare risme di informazioni genetiche su tessuti normali e malati, come parte del progetto Cancer Genome Atlas.
Il Cancer Genome Atlas è un progetto ambizioso realizzato per caratterizzare il materiale genetico di più di 500 tumori da più di 20 diversi tipi di cancro. Il progetto prevede una miniera di dati per bioinformatici come Jones.
“Questi piccoli RNA non codificanti possono essere anche utilizzati per prevedere se gli individui hanno il cancro al seno”, dicono i ricercatori che contribuiscono al progetto Cancer Genome Atlas. I risultati indicano che le differenze nei livelli di specifici tipi di RNA non codificanti possono essere utilizzati per distinguere tra cellule tumorali e non tumorali.
“Per molti anni, i piccoli RNA non codificanti vicino a siti di inizio trascrizionale sono stati considerati come ‘rumore trascrizionale’ a causa della loro apparente distribuzione caotica e l’incapacità di correlare queste molecole con funzioni note o malattie”, spiega Steven Jones, della Simon Fraser University e illustre scienziato presso il BC Cancer Agency. “Utilizzando un approccio computazionale per analizzare piccole informazioni sulla sequenza di RNA che abbiamo generato come parte del progetto Cancer Genome Atlas, siamo stati in grado di filtrare questo rumore per trovare informazioni clinicamente utili”, aggiunge Jones. “I dati dei nostri esperimenti dimostrano che i cambiamenti a livello di genoma nei livelli di espressione di piccoli RNA non codificanti nei primi esoni dei geni codificanti proteine, sono associati con il cancro al seno”.
Gli scienziati sono stati in grado di distinguere tra i tanti diversi piccoli RNA non codificanti che si trovano in prossimità dei siti di inizio della trascrizione dei geni negli individui sani e pazienti con cancro al seno (in questo caso, carcinoma invasivo della mammella). Hanno mappato queste molecole di RNA a posizioni specifiche sulla sequenza del DNA e hanno cercato correlazioni tra gli RNA non codificanti che sono stati fortemente espressi e lo stato di malattia dei pazienti da cui sono stati isolati i campioni di tessuto. I ricercatori hanno poi testato se l’espressione dei piccoli RNA genomici in luoghi che erano in grado di identificare, potrebbe essere utilizzata per prevedere la presenza di malattia in un altro gruppo di campioni di tessuto ottenuti da pazienti noti per avere il cancro al seno. Il test in modo efficiente ha predetto lo stato di malattia.
“Questa è la prima volta che i piccoli non codificanti RNA nei pressi del sito di inizio della trascrizione dei geni, sono stati associati con la malattia”, spiega Jones.
Fonte EMBO reports, 2014; DOI: 10.1002/embr.201337950
