Il numero di questo mese della rivista Molecular & Cellular Proteomics include una ricerca che utilizza nuovi metodi di proteomica per affrontare le domande inevase sul cancro, compresa la variazione delle proteine all’interno dei tumori, il fallimento di alcuni farmaci antitumorali candidati e come le combinazioni di chemioterapici agiscono sinergicamente.
Il profilo spaziale delle proteine rivela una variabilità all’interno dei tumori
È ben noto che i tumori, anche quelli dello stesso tipo, hanno genetica e forme diverse. Questa variazione non esiste solo tra tumori di pazienti diversi, ma anche nelle parti dello stesso tumore. Rimane in gran parte sconosciuto fino a che punto le proteine in un dato tumore variano. In uno studio descritto in Molecular & Cellular Proteomics, Martin Beck e un gruppo di ricercatori del Laboratorio europeo di biologia molecolare tentano di scoprirlo.
“Eravamo interessati a scoprire se le proteine contenute all’interno delle singole cellule del tumore fossero uguali o diverse“, ha affermato Beck. I ricercatori hanno utilizzato la microdissezione laser per profilare l’espressione proteica in diverse parti di biopsie campione da pazienti con carcinoma epatocellulare, il tipo più comune di cancro al fegato.
Per prima cosa, i ricercatori hanno quantificato le differenze di espressione proteica tra il tessuto tumorale e il tessuto normale immediatamente adiacente ad esso, trovando alcuni marker HCC ben noti e alcuni nuovi biomarcatori candidati. Quindi i ricercatori hanno sezionato le regioni all’interno della massa tumorale. Hanno trovato variazioni significative nell’espressione di più proteine tra aree dal centro e la periferia del tumore.
“Possiamo dimostrare che, anche tra cellule apparentemente identiche con la stessa morfologia e lo stesso genoma, ci sono differenze sorprendentemente pronunciate sul livello delle proteine“, ha detto Beck che ha continuato: “Anche le proteine che sono state proposte come biomarcatori non sono distribuite uniformemente sul tumore”. Questo risultato è di immediata importanza clinica.
“È possibile che il campione di tessuto prelevato durante la biopsia non rifletta lo stato reale dell’intero tumore“, ha spiegato Beck. Il metodo sviluppato in questo studio non solo consente di studiare l‘eterogeneità all’interno di un particolare tumore, ma può anche migliorare la ricerca sulla proteomica del cancro in generale. ” Ad esempio”, ha affermato il ricercatore, “potrebbe essere utile per progettare futuri studi per la scoperta dei biomarcatori”.
Perché la terapia con inibitori di FGFR potrebbe fallire
I recettori del fattore di crescita dei fibroblasti, chiamati in breve FGFR, attivano molti percorsi di crescita cellulare e sono iperattivi in diversi tipi di sarcoma. Sebbene gli inibitori di FGFR sembrino una promettente classe di farmaci, hanno fallito negli studi clinici. A volte, non riescono a fermare la crescita di tumori che hanno un’attività FGFR particolarmente alta. Un recente studio ha rivelato un nuovo regolatore di FGFR e questa scoperta può aiutare a spiegare perché il trattamento spesso fallisce. I ricercatori norvegesi hanno trovato un nuovo regolatore FGFR1, il recettore PTPRG della tirosina fosfatasi. Quando il PTPRG è assente, le cellule osteosarcomatiche resistono più efficacemente al trattamento con un inibitore di FGFR1. Gli autori suggeriscono che l’efficacia di molti inibitori di FGFR può dipendere dal fatto che PTPRG sia presente.
Comprensione della sinergia chemioterapica attraverso la proteomica
Combinare i farmaci è un modo preferito per curare i malati di cancro, perché le combinazioni di farmaci possono offrire effetti additivi o sinergici e ritardare lo sviluppo della resistenza ai farmaci. Un nuovo studio condotto dagli scienziati della Univertsità di New York ha rivelato la sinergia tra gli agenti chemioterapici paclitaxel e birinapant nel trattamento delle cellule del cancro del pancreas. I ricercatori hanno scoperto che la terapia di combinazione alterava 289 proteine che non erano state modificate da nessuno dei due farmaci e sopprimeva l’effetto di Warburg nelle cellule tumorali. I ricercatori osservano che il metodo di spettrometria di massa che hanno usato è facilmente riproducibile e può essere utile per comprendere la variabilità tra i pazienti, nella risposta ai regimi di chemioterapia di combinazione.