Cancro del rene aggressivo-Immagine Credit Scitechdaily
I ricercatori hanno scoperto che alcune cellule tumorali esprimono geni responsabili della coagulazione del sangue, che potrebbero essere potenzialmente presi di mira con anticoagulanti nel trattamento del cancro del rene aggressivo.
I ricercatori dell’HSE hanno scoperto geni specifici per il sottotipo più aggressivo di carcinoma renale a cellule chiare. Grigory Puzanov, un ricercatore presso l’HSE Faculty of Computer Science International Laboratory of Bioinformatics, ha analizzato i dati di 456 pazienti con la malattia e ha identificato i sottotipi di cancro che avevano una prognosi favorevole o sfavorevole.
I risultati sono stati pubblicati sulla rivista Scientific Reports.
Il carcinoma renale a cellule chiare (ccRCC) è il tipo più comune di cancro del rene. Negli ultimi decenni, il numero di nuovi casi è aumentato. Sebbene esista una quantità significativa di dati su questa malattia, mancano ancora informazioni su specifici geni umani che potrebbero aiutare a prevederne il decorso clinico.
L’autore dello studio ha analizzato i dati del Cancer Genome Atlas (TCGA) su 456 campioni di tumore per i quali non è stata eseguita alcuna radioterapia o farmacoterapia aggiuntiva. I sottotipi con diversi tassi di sopravvivenza sono stati identificati utilizzando il metodo k-mean per raggruppare i campioni in sottogruppi con caratteristiche simili. Per il clustering genico, Puzanov ha selezionato 2.000 geni con modelli di espressione altamente variabili in ccRCC.
L’espressione genica è il processo mediante il quale un gene viene letto e copiato per produrre un RNA messaggero (mRNA) che viene poi utilizzato per sintetizzare le proteine.
Un algoritmo bioinformatico è stato eseguito 100 volte, ordinando ogni volta i campioni di tumore in base alla somiglianza dei modelli di espressione dei 2.000 geni. Sono stati identificati tre cluster (sottotipi) con diversi tassi di sopravvivenza. Il cluster con i tassi di sopravvivenza più bassi è stato associato a metastasi e alla peggiore risposta al trattamento successivo.
Lo studio è stato condotto in più fasi. Nella prima fase, le caratteristiche di ciascun cluster sono state esaminate per una migliore comprensione dei fattori genetici che potrebbero influenzare il decorso della malattia. Quindi, l’autore dello studio ha identificato i geni chiave specifici dei cluster ad alta e bassa sopravvivenza e ha costruito una rete di interazioni per le proteine la cui sintesi è codificata da questi geni.
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L’analisi di Puzanov ha determinato quali geni codificano le proteine con il maggior numero di connessioni di rete. Il cluster con i tassi di sopravvivenza più bassi è risultato essere associato ai geni MFI2, CP, APOB ed ENAM noti per essere coinvolti nel trasporto del fattore di crescita insulino-simile (una proteina simile nella struttura all’insulina) e nella modifica delle proteine. Inoltre, specifici del sottotipo a bassa sopravvivenza erano i geni che codificano il fibrinogeno e la protrombina associati alla coagulazione del sangue (FGA, FGG e F2).
Alcuni di questi geni chiave possono influenzare l’efficacia delle terapie antitumorali. “Ad esempio, l’aumento dell’attività dei geni CP, FGA e FGG è associato a una scarsa risposta a Nivolumab e un’elevata espressione di APOB ed ENAM predice una mancanza di risposta a Sunitinib. Questa conoscenza può aiutare a prescrivere i trattamenti mirati più adatti per i pazienti con tumori maligni”, dice Grigory Puzanov, Research Fellow, International Laboratory of Bioinformatics, Faculty of Computer Science, HSE University.
Secondo il ricercatore, l’uso combinato di agenti antitumorali convenzionali e anticoagulanti (medicinali che aiutano a prevenire la formazione di coaguli di sangue) può aumentare l’efficacia del trattamento del cancro. Pertanto, ci sono prove che l’Eparina, che è comunemente usata per trattare gli eventi tromboembolici nei pazienti oncologici, contribuisce alla sopravvivenza del paziente e ha attività antimetastatica.
Fonte:Scientific Reports
