Circovirus-immagine Credit Public Domain-
Scienziati dell’Institut Pasteur, Necker-Enfants Malades Hospital (AP-HP), Inserm in the Imagine Institute, Université Paris Cité e Alfort National Veterinary School (EnvA) hanno identificato una specie precedentemente sconosciuta di circovirus, chiamata provvisoriamente circovirus umano 1 (HCirV-1).
I circovirus sono una famiglia di piccoli virus a DNA altamente resistenti, inizialmente identificati nel 1974 in diverse specie animali, dove possono causare problemi respiratori, renali, dermatologici e riproduttivi. HCirV-1 è un nuovo virus che è distante dai noti circovirus animali. È stato dimostrato che è implicato nel danno al fegato di un paziente sottoposto a trattamento immunosoppressivo. Questa scoperta del primo circovirus nell’uomo legato all’epatite, è stata pubblicata su Emerging Infectious Diseases.
Sebbene la trasmissione di virus animali all’uomo sia regolarmente segnalata nella letteratura scientifica, è raro che un nuovo virus venga identificato in un paziente in Europa. Ma nell’ambito di un recente studio, scienziati e medici hanno identificato il primo circovirus coinvolto nell’epatite umana.
“La paziente aveva un’epatite cronica inspiegabile, con pochi sintomi. Aveva ricevuto un trapianto cuore-polmone 17 anni prima e da allora era stata monitorata regolarmente. Abbiamo avuto accesso a un gran numero di campioni nel corso di diversi anni e siamo stati quindi in grado di identificare questo nuovo virus, che era del tutto inaspettato“, spiega Marc Eloit, ultimo autore dello studio, capo del laboratorio Pathogen Discovery dell’Institut Pasteur e Professore di virologia presso la Alfort National Veterinary School (EnvA).
Il suo laboratorio è specializzato nell’identificazione di agenti patogeni in pazienti sospettati di infezione grave di causa sconosciuta.
Nel marzo 2022, in collaborazione con il Dipartimento di Microbiologia Clinica dell’Ospedale Necker-Enfants Malades (AP-HP), sono stati sequenziati i campioni di tessuto patologico di questa paziente di 61 anni che riceveva un trattamento immunosoppressivo, la cui epatite non aveva una causa identificabile, alla ricerca di sequenze microbiche. Le sequenze di RNA (acido ribonucleico) estratte dai tessuti sono state analizzate e confrontate con quelle di microbi noti.
“L’obiettivo è identificare sequenze di interesse tra tutte le sequenze ottenute, che è come cercare un ago in un pagliaio”, continua lo scienziato Marc Eloit. Queste migliaia di sequenze di RNA sono state analizzate in parallelo utilizzando tecniche di sequenziamento ad alto rendimento mNGS (sequenziamento metagenomico di nuova generazione) e sofisticati algoritmi. Dopo aver escluso eziologie comuni, l’analisi ha portato all’identificazione di una specie di circovirus precedentemente sconosciuta, denominata provvisoriamente circovirus umano 1 (HCirV-1). Non è stata trovata altra sequenza virale o batterica.
Il coinvolgimento di HCirV-1 nell’epatite è stato poi dimostrato analizzando campioni prelevati dalla paziente negli anni precedenti come parte del suo trattamento post-trapianto. I risultati hanno mostrato che il genoma virale di HCirV-1 non era rilevabile nei campioni di sangue dal 2017 al 2019, quindi che la sua concentrazione ha raggiunto il picco nel settembre 2021. È stata dimostrata la replicazione virale nelle cellule del fegato (dal 2 al 3% delle cellule del fegato erano infette), indicando il ruolo di HCirV-1 nel danno epatico: una volta che il virus ha utilizzato le risorse nella cellula epatica per replicarsi, distrugge la cellula.
Da novembre 2021 in poi, dopo il trattamento antivirale, gli enzimi epatici del paziente sono tornati a livelli normali, indicando la fine della citolisi epatica.
La diagnosi di epatite di eziologia sconosciuta rimane una sfida importante, come dimostrato dai casi di epatite acuta segnalati nei bambini nel Regno Unito e in Irlanda lo scorso aprile e segnalati dall’OMS.
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Sebbene alcuni circovirus siano patogeni per gli animali a cui si possano somministrare vaccini, specialmente nei suini, questo è il primo circovirus conosciuto ad essere patogeno per l’uomo. I sintomi del paziente sono rimasti lievi; il virus è stato identificato perché è stata attentamente monitorata la paziente, dopo il suo trapianto combinato.
L’origine del virus, se è circolante nell’uomo o di origine animale, deve ancora essere identificata e la fonte dell’infezione (contatto, cibo, ecc.) rimane sconosciuta. In seguito alla loro scoperta, gli scienziati hanno sviluppato uno specifico test PCR che è ora disponibile per la diagnosi eziologica dell’epatite di origine sconosciuta. È in fase di sviluppo anche un test sierologico.
“Questi risultati mostrano il valore di questo tipo di analisi di sequenziamento nell’identificazione di agenti patogeni nuovi o inaspettati. È sempre importante che i medici sappiano se un’infezione è virale o meno, in modo da poter adattare il trattamento di conseguenza. È anche fondamentale essere in grado di identificare un nuovo agente patogeno quando un’infezione rimane inspiegabile e sviluppare un test diagnostico, perché qualsiasi nuovo caso di infezione umana con un agente patogeno emergente può potenzialmente segnalare l’inizio di un’epidemia”, conclude Marc Eloit. Il test è disponibile per la comunità medica e ora può essere facilmente eseguito per altri casi di epatite inspiegabile.
Fonte:Emerging Infectious Diseases