(SARS-CoV-2-Credito di immagine: FOTOGRIN/Shutterstock.com).
In una recente lettera al Journal of Medical Virology, i ricercatori esplorano i cambiamenti che si verificano nel tempo nella sindrome respiratoria acuta grave coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Da quando SARS-CoV-2 è emerso per la prima volta alla fine di dicembre 2019, ha infettato oltre 472 milioni di persone in tutto il mondo e causato oltre 6,09 milioni di morti.
Mentre nelle nazioni sviluppate, i programmi di vaccinazione di massa hanno contribuito a ridurre i danni causati dalla malattia del coronavirus 2019 (COVID-19), milioni di persone devono ancora ricevere un vaccino. Inoltre, l’emergere di nuove varianti SARS-CoV-2 in grado di eludere l’immunità sia naturale che indotta dal vaccino minaccia anche l’efficacia degli attuali vaccini COVID-19. Comprendere la natura dei cambiamenti avvenuti dall’inizio della pandemia potrebbe aiutare a prevenire più morti in futuro.
Una breve storia del COVID-19
Nonostante gli sforzi locali e internazionali per fermare la trasmissione di SARS-CoV-2, questo virus si è diffuso rapidamente nel resto del mondo, con gravi epidemie inizialmente segnalate nei paesi vicini alla Cina e all’Europa prima di essere infine rilevato in quasi tutte le Nazioni del mondo.
I coronavirus sono suddivisi in quattro generi; tuttavia, solo gli alfacoronavirus e i betacoronavirus sono in grado di infettare l’uomo. SARS-CoV-2 condivide circa l’89% di identità di sequenza con altri coronavirus umani e l’89-96% di omologia con il coronavirus trovato nei pipistrelli, suggerendo così un’origine zoonotica. I media hanno rapidamente identificato questo dettaglio, che spesso viene erroneamente riportato come un salto diretto dai pipistrelli agli umani. Tuttavia, un’analisi più approfondita ha rivelato diverse altre potenziali fonti di questo virus, incluso almeno un ospite intermedio che ha trasferito SARS-CoV-2 dai pipistrelli all’uomo.
Mutazioni e varianti SARS-CoV-2
L’esone della proteina 14 (nsp14) non strutturale codifica per un’esonucleasi di correzione di bozze dell’acido ribonucleico (RNA) progettata per garantire la fedeltà della riproduzione genetica di SARS-CoV-2. Nonostante ciò, nel corso della pandemia si sono accumulate mutazioni significative in SARS-CoV-2.
Le mutazioni SARS-CoV-2 più importanti che emergono sono quelle che colpiscono la proteina spike che è responsabile dell’ingresso cellulare e della fusione della membrana. In effetti, la prima variante ufficiale di SARS-CoV-2 portava una mutazione in D614G sulla proteina spike, che in seguito è diventata prevalente in tutto il mondo.
Alpha (B.1.1.7), Beta (B.1.351), Gamma (P1), Delta (B.1.617.2) e Omicron (B.1.1.529) ) sono varianti.
Le mutazioni nella proteina spike possono consentire a SARS-CoV-2 di sfuggire al rilevamento immunitario, consentendo così l’infezione nonostante la precedente vaccinazione. Ad oggi, la variante SARS-CoV-2 Omicron è particolarmente nota per la sua capacità di causare infezioni rivoluzionarie.
Recentemente sono stati sviluppati diversi farmaci in grado di proteggere gli individui, nonostante le continue mutazioni. La maggior parte di queste terapie prende di mira la proteasi virale principale Mpro/3CL proteasi o RNA polimerasi RNA-dipendente (RdRp), che sono conservate in tutte le varianti. Poiché l’immunità contro SARS-CoV-2 svanisce in modo relativamente rapido, farmaci come Remdesivir, Molnupiravir e PAXLOVID potrebbero aiutare a fornire un’alternativa ai costanti potenziatori del vaccino.
Aumento della trasmissibilità e ridotta gravità dell’infezione da Omicron
Alcune mutazioni, come quelle all’interno della regione regolatoria dei geni del nucleocapside open reading frame 9b (Orf9b) e Orf6, possono portare a una maggiore espressione. Per questi geni particolari, questo ritarda la risposta immunitaria dell’ospite, aumentando così la forma fisica virale.
Vedi anche:SARS-CoV-2: risposte anticorpali in calo nelle persone infette o vaccinate
In particolare, la variante Omicron è costituita da un elevato numero di mutazioni che hanno contribuito alla sua maggiore trasmissibilità. Inoltre, la variante Omicron si lega al recettore dell’enzima di conversione dell’angiotensina 2 (ACE2) con il 44% in più di affinità rispetto al ceppo wild-type.
Tuttavia, altre mutazioni di Omicron sembrano ridurre la gravità dell’infezione con questa variante una volta all’interno della cellula ospite. In effetti, la variante Omicron mostra carichi virali significativamente ridotti nelle vie aeree umane rispetto ad altre cellule, mentre l’elaborazione ridotta della proteina spike sembra ridurre significativamente la trasmissione da cellula a cellula. La variante Omicron sembra anche essere più vulnerabile al decadimento basato sulla temperatura rispetto ad altre varianti.
Conclusioni
La ridotta gravità della variante Omicron, così come la sua ascesa al dominio in diverse nazioni, potrebbero suggerire che questo virus potrebbe aver acquisito queste mutazioni in Africa, dove è salito alla ribalta per la prima volta, soprattutto perché molte nazioni africane hanno livelli di vaccinazione più bassi. Altre teorie ipotizzano che SARS-CoV-2 possa aver sperimentato diversi eventi zoonotici aggiuntivi, in cui il virus ha acquisito nuove mutazioni fino a quando non è tornato all’uomo.
L’elevata trasmissibilità e la bassa gravità della variante SARS-CoV-2 Omicron potrebbero consentirle di agire come una dose di vaccino naturale; tuttavia, molti altri scienziati non supportano questra idea. COVID-19 può ancora essere mortale per le persone anziane e immunocompromesse; pertanto, è probabile che consentire a una vasta popolazione di fungere da serbatoio consenta l’insorgere di varianti nuove e potenzialmente più pericolose.
Tuttavia, la ridotta gravità di Omicron potrebbe ancora fornire qualche speranza, poiché qualsiasi malattia zoonotica mostra una gravità significativamente inferiore nel tempo mentre i virus si adattano ai loro nuovi ospiti. È certamente possibile che SARS-CoV-2 possa continuare su questa strada.
Fonte:Medical Virology
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