(SARS-CoV-2-Immagine Credito: © dottedyeti / stock.adobe.com).
In un modello di evoluzione ricorrente, SARS-CoV-2 elude le risposte immunitarie eliminando selettivamente piccoli frammenti della sua sequenza genetica, secondo una nuova ricerca dell’Università di Pittsburgh School of Medicine.
“Poiché queste delezioni avvengono in una parte della sequenza che codifica per la forma della proteina spike, l’anticorpo precedentemente neutralizzante non può afferrare il virus”, riferiscono i ricercatori oggi su Science. E poiché il “correttore di bozze” molecolare che di solito rileva gli errori durante la replicazione di SARS-CoV-2 è “cieco” per correggere le delezioni, queste si cementano nel materiale genetico della variante.
Autore senior dello studio è Paul Duprex, Ph.D., Direttore del Center for Vaccine Research presso l’Università di Pittsburgh.
Da quando il documento è stato presentato per la prima volta come prestampa a novembre, i ricercatori hanno osservato questo modello svilupparsi, poiché diverse varianti motivo di preoccupazione si diffondevano rapidamente in tutto il mondo. Le varianti identificate per la prima volta nel Regno Unito e in Sud Africa hanno queste delezioni di sequenza.
Il gruppo di Duprex si è imbattuto per la prima volta in queste delezioni resistenti alla neutralizzazione in un campione di un paziente immunocompromesso, che è stato infettato da SARS-CoV-2 per 74 giorni prima di morire a causa di COVID-19. Questo lungo tempo di infezione offre al virus e al sistema immunitario la possibilità di giocare a “gatto e topo” e offre ampie opportunità di avviare la danza coevolutiva che si traduce in queste preoccupanti mutazioni nel genoma virale che si stanno verificando in tutto il mondo.
Quindi, Duprex si è avvalso dell’aiuto dell’autore principale dello studio Kevin McCarthy, Ph.D., assistente Professore di biologia molecolare e genetica molecolare alla Pitt University e esperto di virus influenzale – un maestro dell’evasione immunitaria – per vedere se le delezioni presenti nelle sequenze virali di questo paziente potrebbero far parte di una tendenza più ampia.
McCarthy e colleghi hanno esaminato attentamente il database delle sequenze SARS-CoV-2 raccolte in tutto il mondo da quando il virus si è diffuso per la prima volta negli esseri umani.
Quando il progetto è iniziato, nell’estate del 2020, si pensava che SARS-CoV-2 fosse relativamente stabile, ma più McCarthy ha esaminato il database, più cancellazioni ha visto ed è emerso un modello. Le delezioni continuavano a verificarsi negli stessi punti della sequenza, punti in cui il virus può tollerare un cambiamento di forma senza perdere la sua capacità di invadere le cellule e fare copie di se stesso.
“L’evoluzione si stava ripetendo”, ha detto McCarthy, che di recente ha avviato un laboratorio di virologia strutturale presso il Pitt’s Center for Vaccine Research.
Tra le sequenze identificate da McCarthy come aventi queste delezioni c’era la cosiddetta “variante del Regno Unito” – o per usare il suo nome proprio, B.1.1.7. A questo punto, era ottobre 2020 e B.1.1.7 non era ancora decollato. In effetti, non aveva nemmeno un nome, ma era presente nei set di dati. La tensione non stava ancora emergendo e nessuno sapeva allora il significato che queste delezioni avrebbero avuto. Ma l’analisi di McCarthy l’ha colto in anticipo cercando modelli nella sequenza genetica.
In modo rassicurante, il ceppo identificato in questo paziente di Pittsburgh è ancora suscettibile di neutralizzazione da parte dello sciame di anticorpi presenti nel plasma convalescente, dimostrando che la fuga mutazionale non è tutto o niente. Ed è importante rendersene conto quando si tratta di progettare strumenti per combattere il virus.
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“Inseguire il virus in molti modi diversi è il modo in cui sconfiggiamo il mutaforma”, ha detto Duprex. “Combinazioni di diversi anticorpi, combinazioni di nanobodies con anticorpi, diversi tipi di vaccini. Se c’è una crisi, vorremo avere quei backup”.
Sebbene questo documento mostri come è probabile che SARS-CoV-2 sfugga ai vaccini e alle terapie esistenti, è impossibile sapere esattamente a questo punto quando ciò potrebbe accadere. I vaccini COVID-19 oggi sul mercato continueranno a offrire un elevato livello di protezione per altri sei mesi? Un anno? Cinque anni?
“Fino a che punto queste eliminazioni erodono la protezione è ancora da determinare”, ha detto McCarthy. “Ad un certo punto, dovremo iniziare a riformulare i vaccini, o almeno prendere in considerazione l’idea”.
Altri autori dello studio includono Linda Rennick, Ph.D., Sham Nambulli, Ph.D., di Pitt; Lindsey Robinson-McCarthy, Ph.D., formalmente Harvard Medical School e ora lavora come virologo presso l’UPMC Hillman Cancer Center e William Bain, MD, e Ghady Haidar, MD, della Pitt e UPMC rispettivamente.
Il finanziamento per questo studio è stato fornito dalla Richard King Mellon Foundation, Hillman Family Foundation e UPMC Immune Transplant and Therapy Center.
Fonte:ScienceDaily
