Immagine: i domini topologicamente associati (TAD) sono regioni distinte del genoma con limiti rigorosi che impediscono ai domini di interagire con il materiale genetico nei TAD vicini. Credito: Jin Szatkiewicz, PhD, UNC School of Medicine.
La maggior parte delle ricerche sulla genetica della schizofrenia ha cercato di comprendere il ruolo che i geni svolgono nello sviluppo e nell’ereditarietà della condizione. Sono state fatte molte scoperte, ma ci sono stati molti pezzi mancanti. Ora, gli scienziati della School of Medicine dell’UNC hanno condotto il più grande studio sulla schizofrenia di sequenziamento del genoma per fornire un quadro più completo del ruolo del genoma umano in questa malattia.
Pubblicato in Nature Communications, lo studio co-diretto dall’autore senior Jin Szatkiewicz, Ph.D., Professore associato presso il Dipartimento di genetica della UNC, suggerisce che rare varianti genetiche strutturali potrebbero svolgere un ruolo nella schizofrenia.
“I nostri risultati suggeriscono che varianti strutturali ultra rare che influenzano i confini di una specifica struttura del genoma aumentano il rischio di schizofrenia“, ha detto Szatkiewicz. “Le alterazioni in questi limiti possono portare alla disregolazione dell’espressione genica e pensiamo che futuri studi meccanicistici potrebbero determinare gli effetti funzionali precisi che queste varianti avranno sulla biologia“.
Precedenti studi sulla genetica della schizofrenia hanno riguardato principalmente l’uso di variazioni genetiche comuni note come SNP (alterazioni delle sequenze genetiche comuni e ciascuna delle quali colpiscono un singolo nucleotide), rare variazioni nella parte del DNA che forniscono istruzioni per produrre proteine o variazioni strutturali molto grandi (alterazioni che colpiscono alcune centinaia di migliaia di nucleotidi).
Questi studi forniscono istantanee del genoma, lasciando una grande parte del genoma avvolto in un mistero. Nello studio pubblicato su Nature Communications, Szatkiewicz e colleghi hanno esaminato l’intero genoma, usando un metodo chiamato sequenziamento dell’intero genoma (WGS). Il motivo principale per cui WGS non è stato più ampiamente utilizzato è che è molto costoso. Per questo studio, una collaborazione internazionale ha messo insieme fondi provenienti dal National Institute of Mental Health, sovvenzioni e fondi corrisposti dagli SciLife Labs svedesi per condurre un profondo sequenziamento dell’intero genoma su 1.165 persone con schizofrenia e 1.000 controlli, il più grande studio WGS sulla schizofrenia mai realizzato.
